「連動」タブの機能で、工事未収入金の振替伝票を作成する際に「補助科目」を設定しての振替伝票作成は可能でしょうか?

工事未収入金(売掛金)に関しては、補助科目を設定・作成することができます。
「連動」タブの「財務会計連動設定」を開き「補助コード」ボタンを押すと、得意先の補助コードを付加することができます。
例えば「MFクラウド」ですと、補助科目のフィールドには「得意先名」が出力されるはずです。