見積書で個人あてに見積もりを出す場合、「御中」ではなく「様」で出したいのですが。

リボンメニューの「マスター」⇒「得意先登録」でその人を呼び出してください。
そして、「F2 詳細設定」⇒「債権・請求書発行」で、「敬称」を「御中」から「様」に変更してください。
この設定値は得意先ごとに持ち、見積書、請求書などで反映されます。